채널 j 다운로드

그림 1. 전압 게이트 칼륨 채널, 운동 특성 화 워크플로우. (A) 145개의 공지된 전압 게이트 이온 채널 유전자의 방사형 계통유전학적 나무, 여기서 반은 칼륨 채널(녹색)이다. 우리의 연구는 12 개의 하위 패밀리 (확장 영역)로 나누어 40 전압 게이트 칼륨 (Kv) 채널에 초점을 맞추고 있습니다. (b) 모든 래트 Kv 채널 유전자의 isoform1의 코딩 서열의 쌍선형 정렬로부터 수득된 계통유전학적 트리; 눈금은 정규화된 계통유전학 적 거리를 나타냅니다. 상응하는 Kv 단백질 이름은 (쥐를 위한 접두사 r 스탠드)를 표시한다. 각 Kv 채널의 단백질 구조의 개략적 및 스케일링된 묘사는 각 도메인의 아미노산 길이를 기초한다. (C) Kv 채널 운동 특성화를 위한 표준화된 워크플로우. 각 Kv 유전자는 랫트 뇌 cDNA 라이브러리로부터 증폭되고 포유류 발현 벡터(표 S6)에서 복제되고, 발현 벡터의 라이브러리를 구축한다. 숙주 세포주에서 각 발현 벡터의 형질전환 후 안정적인 세포주 라이브러리가 생성된다(CHO, HEK, 또는 CV1; 도면 S1, S2 및 표 S7을 참조하십시오. 각 세포주의 역학은 전용 온도 제어 실(14-36°C)에서 자동 패치 클램프 설정(APC)을 사용하는 것이 특징입니다. 표 S8)을 참조하십시오.

기록된 각 셀에는 고유 ID(셀 ID)가 할당됩니다. 전기 생리학 데이터는 “Channelpedia” 웹 사이트를 통해 분석, 저장 및 공유됩니다. 결과의 공유와 추가 검증을 용이하게 하기 위해, 우리는 위키와 같은 웹 리소스 (https://channelpedia.net 또는 https://channelpedia.epfl.ch)로 연구에서 모든 원시 및 처리 된 데이터를 출판했으며, 학술적 용도로 자유롭게 사용할 수 있습니다. 각 셀에는 데이터 파일 이름에 추가되는 고유한 셀 ID가 할당되었습니다. 원시 데이터 파일은 전압 프로토콜의 각 반복에 대해 기록된 전류와 적용된 자극에 대한 설명을 제공합니다. 분석된 데이터 파일에는 각 프로토콜의 각 반복 기록에서 추출된 기능이 포함되어 있습니다. 각 Kv IC에 대한 실험 및 분석 데이터는 Channelpedia 웹 사이트의 “실험 데이터” 섹션에서 국경없는 신경 데이터(NWB) 형식으로 제공됩니다. NWB는 데이터 표준화 및 공유를 촉진하기 위해 설계된 새로운 형식입니다(Teeters et al., 2015). NWB는 HDF5 파일 형식을 기반으로하므로 모든 HDF5 뷰어로 볼 수 있습니다.

원시 데이터, 자극 및 메타데이터는 각각 “수집/타임시리즈”, “자극/프리젠테이션” 및 “일반”에 저장됩니다. 데이터는 웹 인터페이스 또는 REST API를 통해 액세스할 수 있습니다. 18,700개 이상의 셀에서 1백만 개 이상의 기록 추적을 사용할 수 있으며 학술용으로 다운로드할 수 있습니다. 힐레, B. (2001). 흥분 멤브레인의 이온 채널. 선덜랜드: 매스 시나우어. 이온 채널 연구에서 처음으로, IC의 전체 가족에서 전기 생리학 데이터를 입수하고 공개적으로 사용할 수 있게 되었습니다.

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